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16S/18S/ITS等扩增子测序

扩增子测序根本根据对特指时间的PCR恶果时常测序汇总,针对处所样张,16S/18S/ITS等遗传扩增子测序是大放厥词处所微原核生物多样性及种群构成差距的紧要别的技术找个办法之一。

根据有差异的大放厥词目标和需要,w88体育补给4种扩增子残品:16SrDNA测序、18SrDNA测序、ITS测序及疗效遗传处所测序。现实介绍以下:


16SrDNA测序

        16SrDNA为编码原核原核生物核糖体小亚基rRNADNA流水作业,存在10个激进处所和9个高变处所(1V1-V9),有一点激进区在螺旋体间差距有限,高变区存在属或种的特异性,对16SrDNA哪一个高变区时常测序,用在大放厥词处所微原核生物中螺旋体或古菌的种群布局多样性。



18SrDNA测序

 

18SrDNA为编码真核原核生物核糖体小亚基rRNADNA流水作业。对18SrDNA哪一个高变区时常测序,用在大放厥词处所样张中真核微原核生物种群布局多样性。


ITSrDNA测序

ITS分辨某些处所:ITS1ITS2ITS1地址在真核原核生物rDNA流水作业18S5.8S之间,ITS2地址在真核原核生物rDNA流水作业5.8S28S之间。对ITS1ITS2时常测序,用在大放厥词处所微原核生物中霉菌种群布局多样性。




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